Programovanie pre fyzikov

Vojtova webstránka: ipnp.cz/?page_id=8042&lang=CZ Prezentácia Prezentácia a príklady v Jupyter notebooku: prop_chyb.ipynb Príklady Príklady od Vojtecha k propagácii chýb: uncertainty_propagation_examples.py Skript z minulého cvičenia (iba na import plot funkcie): fits_examples.py Odporúčané predmety Základy programovania Použití počítačů ve fyzice NOFY084 - praktické fyzikálne príkady, vhodné na zlepšenie rutiny programovania (v Pythone), KZ za úlohy Programování a zpracování dat v Pythonu NOFY178 - vyššia úroveň programovania v Pythone (triedy, dekorátory,…), vhodné na zlepšenie dizajnu kódu, KZ za úlohy Strojové učenie (AI) Strojové učení v částicové fyzice NJSF164 - základy hlbokého učenia formou príkladov, vhodné aj pre začiatočnikov strojového učenia, moderné techniky AI, vhodné pre všetkých (nielen časticová fyzika), Zk za úkoly Úvod do strojového učení v Pythonu NPFL129 - strojové učenie, príklady+teória, náročejšie, témy do hĺbky, nie moderné techniky AI (skorej klasické), Zk písomná, Z za úlohy, viac info Hluboké učení NPFL138 - hlboké učenie, príklady+teória, náročné, témy do hĺbky, najmodernejšie techniky AI, Z za úlohy, Zk písomná alebo v prípade splnenia všetkých úloh rovno za 1, viac info Some random link

Running Athena

Prerequisites Get a CERN login. Generate a Kerberos authentication ticket using the command and type your password when prompted: kinit Check if the ticket is generated using: klist klist -f Create a fork of the Athena repository. THE PROJECT NAME MUST BE AS THE ORIGINAL: athena. Setup a working environment ssh to lxplus or other CERN machine. Setup the environment: setupATLAS lsetup git Setup the git-atlas (change sjankovy to your username): git atlas init-config sjankovy --apply Check if the configuration is correct with git atlas init-config.

Setup MFF UK GPULab

Prerequisites Get a CAS login. Login to gpulab using CAS login, follow this guide. Charliecloud image Log into a gpu node srun -p gpu-ffa --gpus=1 --time=5:00:00 --pty bash Pull nvidia docker image with Charliecloud ch-image pull tensorflow/tensorflow:latest-gpu Convert the docker image to charliecloud image expressed as a directory ./my-tf ch-convert -i ch-image -o dir tensorflow/tensorflow:latest-gpu ./my-tf Import CUDA libraries ch-fromhost --nvidia ./my-tf Launch the container ch-run -w -c /home/jankovys --bind=/home/jankovys -u 0 -g 0 ./my-tf -- bash The command above will launch the container with working directory /home/jankovys and write access to the container (-w). The --bind=/home/jankovys option will bind the /home/jankovys directory on the host to the /home/jankovys directory in the container. The -u 0 -g 0 options will run the container as root user. The -- at the end of the command tells ch-run that the command to run in the container follows.

TBrowser in docker container

Set up Install Docker Pull the ROOT (rootproject/root:6.26.06-ubuntu22.04) docker image: docker pull rootproject/root:6.26.06-ubuntu22.04 Run the docker image: docker run -p 9200:9200 --rm -d -it -v ~/host/dir:/container/dir --name TBrowser rootproject/root:6.26.06-ubuntu22.04 root -l --web=server:9200 /opt/root/tutorials/v7/browser.cxx -p 9200:9200 maps the port 9200 of the host to the port 9200 of the container --rm removes the container after it exits -d runs the container in the background -it runs the container in interactive mode -v ~/host/dir:/container/dir mounts the host directory ~/host/dir to the container directory /container/dir --name TBrowser names the container TBrowser rootproject/root:latest is the docker image root -l --web=server:9200 /opt/root/tutorials/v7/browser.cxx runs the ROOT TBrowser in the container Open a web browser and go to localhost:9200/win1 to see the TBrowser:

Tips and Tricks

Tips and Tricks Git+latexdiff Generate a latexdiff between two commits git latexdiff 0db4b84289f7554810cfdaacf7bafdbab23466b2 -- --main ANA-JETM-2023-07-PUB.tex

Arch Linux Installation Download the ISO image Download the latest Arch Linux ISO from here. Create empty disk image Create the empty file with filled zeros of size 64GB: dd if=/dev/zero of=bios.img bs=2G count=32 Boot the ISO image Make sure to have the OVMF package installed: pacman -S ovmf This package contains the UEFI firmware for QEMU. Copy the UEFI firmware to the current directory: cp /usr/share/edk2/x64/OVMF_VARS.fd . Boot the ISO image with QEMU: